ზუსტი დამთხვევა
ორიგინალის ენა
ქვეკორპუსები
ჯგუფები
კრებულები
ტიპები
ჟანრები
დარგები
გამომცემლობები
ავტორები
მთარგმნელები
გამოცემულია
წლიდან
წლამდე
თარგმნილია
წლიდან
წლამდე
2281.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ავტომატიზებულმა ფუძის გამოძახებამ შეიძლება შეცდომები მოგვცეს, ამიტომ ხშირად საჭიროა ექსპერტის ჩარევა, რომ თანმიმდევრობის გამოძახებები შესწორდეს.
Automated base callingmaygenerate errors andhumanintervention is often required to correct the sequence calls.
2282.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
საფანტის თოფიდან გასროლა კლონირებული დნმ-ს ორივე ბოლოდან კლონებს შემთხვევით სეკვენირებს.
The shotgun approach randomly sequences clones from both ends of cloned DNA.
2283.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ეს მიდგომა ქმნის დნმ-ს სეკვენირებული ფრაგმენტების დიდ რაოდენობას.
This approach generates a large number of sequenced DNA fragments.
2284.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ეს მიდგომა არ საჭიროებს კლონის ფრაგმენტების ფიზიკური დარუკების ცოდნას. ის უფრო ზუსტი კომპიუტერული პროგრამების ნაკრებია, რომლებიც აერთიანებენ შემთხვევითი ფრაგმენტების მონაკვეთებს ერთი მთლიანი გენომის თანმიმდევრობაში.
This approach does not require knowledge of physical mapping of the clone fragments, but rather a robust computer assembly program to join the pieces of random fragments into a single, whole-genome sequence.
2285.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ზოგადად, გენომი უნდა ჭარბად სეკვენირდეს ისე, რომ ფრაგმენტების მთლიანმა სიგრძემ სრული გენომი მრავალჯერ დაფაროს.
Generally, the genome has to be redundantly sequenced in such a way that the overall length of the fragments covers the entire genome multiple times.
2286.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ეს ხორციელდება სეკვენირების შეცდომების მინიმიზაციის მიზნით და მოსაზღვრე თანმიმდევრობების ზუსტი გაერთიანების გარანტირებისთვის.
This is designed to minimize sequencing errors and ensure correct assembly of a contiguous sequence.
2287.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
გადამფარავ თანმიმდევრობებს, რომელთა საერთო სიგრძე ექვსჯერ ან ათჯერ აღემატება გენომის ზომას, ნორმალურად ამ მიზნისთვის იყენებენ.
Overlapping sequences with an overall length of six to ten times the genome size are normally obtained for this purpose.
2288.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
მრავლობითი დაფარვის მიუხედავად, ზოგჯერ კონკრეტული გენომური რეგიონები არასეკვენირებული რჩება, ძირითადად კლონირების სირთულეების გამო.
Despite the multiple coverage, sometimes certain genomic regions remain unsequenced, mainly owing to cloning difficulties.
2289.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ამ შემთხვევებში, ნარჩენი გეპ თანმიმდევრობები შეიძლება დავადგინოთ თანმიმდევრობების გაფართოებით, ცნობილი გენომური თანმიმდევრობების რეგიონებიდან, რაც უფრო ტრადიციული PCR მეთოდის გამოყენებით ხორციელდება, რომელიც ითხოვს დამზადებული პრაიმერების გამოყენებას და გენომზე ცოცვას ეტაპობრივი მანერით ახორციელებს.
In such cases, the remainder gap sequences can be obtained through extending sequences from regions of known genomic sequences using a more traditional PCR technique, which requires the use of custom primers and performs genome walking in a stepwise fashion.
2290.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
გენომის სეკვენირების ეს ეტაპი ასევე ცნობილია თევზაობის სახელით, რასაც მოჰყვება თანმიმდევრობის ყველა მონაცემის კომპიუტერული დაკავშირება საბოლოო სრულ გენომში.
This step of genome sequencing is also known as finishing, which is followed by computational assembly of all the sequence data into a final complete genome.
2291.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ყოველი ინდივიდუალური BAC კლონის სრული თანმიმდევრობა შეიძლება დადგინდეს საფანტის თოფის მიდგომის გამოყენებით.
The complete sequence of each individual BAC clone can be obtained using the shotgun approach.
2292.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
გადაფარვადი BAC კლონები შემდგომში გენომის სრულ თანმიმდევრობად ერთიანდება.
Overlapping BAC clones are subsequently assembled into an entire genome sequence.
2293.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
საპირისპიროდ, სრული გენომის საფანტის თოფის მიდგომამ შეიძლება თანმიმდევრობის შავი ვარიანტი ძალიან სწრაფად მოგვცეს, ვინაიდან ის დაფუძნებულია პირდაპირი სეკვენირების მიდგომაზე.
In contrast, the whole genome shotgun approach can produce a draft sequence very rapidly because it is based on the direct sequencing approach.
2294.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ამ მიდგომას წარმატებულად იყენებენ მცირე, მიკრობული გენომების სეკვენირებისას, მაგრამ რთული ევკარიოტული გენომის შემთხვევაში, რომელიც განმეორებადი თანმიმდევრობების დიდ რაოდენობას შეიცავს, მაგალითად, ადამიანის გენომის შემთხვევაში, საფანტის თოფის სრული მიდგომა იერარქიული მიდგომაზე ნაკლებად ზუსტია და მიდრეკილია საბოლოო, გაერთიანებულ თანმიმდევრობაში მრავალი „სიცარიელეების“ დატოვებისკენ.
Although the approach has been successfully employed in sequencing small microbial genomes, for a complex eukaryotic genome that contains high levels of repetitive sequences, such as the human genome, the full shotgun approach becomes less accurate and tends to leave more "holes" in the final assembled sequence than the hierarchical approach.
2295.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
როგორც აღვწერეთ, დნმ-ს საწყისი სეკვენირების რეაქციები მოკლე თანმიმდევრობებს გვაძლევენ, რომლებიც დნმ-ს კლონიდან ამოიკითხება.
As described, initial DNA sequencing reactions generate short sequence reads from DNA clones.
2296.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
მთლიანი გენომის თანმიმდევრობის აწყობის მიზნით ეს მოკლე ფრაგმენტები ერთიანდება, რომ გადაფარვების ამოგდების შემდეგ უფრო დიდი ფრაგმენტები შეიქმნას.
To assemble a whole genome sequence, these short fragments are joined to form larger fragments after removing overlaps.
2297.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
ამ უფრო გრძელ, შერწყმულ თანმიმდევრობებს მოსაზღვრეებს უწოდებენ. როგორც წესი, მათი სიგრძე 5 000 - 10 000 ფუძის ტოლია.
These longer, merged sequences are termed contigs, which are usually 5,000 to 10,000 bases long.
2298.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
გადამფარავი რეგიონების ზუსტი დადგენა და თანმიმდევრობის ამოკითხვების კონტიგებში გაერთიანება, წააგავს თავსატეხი სურათის შედგენას, რომელიც კომპიუტერულად შეიძლება ძალიან შრომატევადი იყოს, როცა საქმე გვაქვს მთელი გენომის მონაცემებთან.
Correct identification of overlaps and assembly of the sequence reads into contigs are like joining jigsaw puzzles, which can be very computationally intensive when dealing with data at the whole-genome level.
2299.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
გენომის აწყობის მთავარი პრობლემაა თანმიმდევრობაში დაშვებული შეცდომები, ბაქტერიული ვექტორებით დაბინძურება, და თანმიმდევრობის განმეორებადი რეგიონები.
The major challenges in genome assembly are sequence errors, contamination by bacterial vectors, and repetitive sequence regions.
2300.
ბიოინფორმატიკის საფუძვლები | თავი 17
სეკვენირების შეცდომები ხშირად შეიძლება შესწორდეს მრავალი გადამფარავი თანმიმდევრობის გათანაბრების შედეგად კონსენსუსის დადგენით.
Sequence errors can often be corrected by drawing a consensus from an alignment of multiple overlapped sequences.